Το παιχνίδι έχει αναπτυχθεί σε ένα μυστικό εργαστήριο που βρίσκεται στο κάτω μέρος του ωκεανού. Εδώ στη μοναξιά έζησε ένα εκκεντρικό επιστήμονα, τις εμπειρίες και τα πειράματα τους συναδέλφους να τον κατηγορήσει. Κύριο καθήκον του ήταν να δημιουργήσει ένα ζωντανό είναι προικισμένοι με λογική και χρόνια αργότερα το έκανε. Αλλά την ίδια στιγμή ο δημιουργός εξαφανίστηκε κάτω από μυστηριώδεις συνθήκες, αφήνοντας Goo (αυτό το όνομα έχει λάβει απογόνους του) και να περιμένουν γι 'αυτόν να χάσετε. Ήρωας κουραστεί να κρέμεται σε μια φιάλη-κάμερα και να βγει από αυτό, πήγε για μια περιοδεία του συγκροτήματος για να βρει τα ίχνη των αγνοουμένων φίλου. Η δυνατότητα να επιλέξει το βαθμό ελαστικότητας θα βοηθήσει να ξεπεραστούν διάφορα εμπόδια, να αντιμετωπίσουν τον εχθρό και να διεισδύσει στο σημείο όπου ο απλός άνθρωπος ή πώς να μην πάρει.